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代謝系統疾病:苯丙酮尿症(PAH)、楓糖尿症(BCKDHA/BCKHB)、甲基丙二酸血症(MMUT/MMACHC)、戊二酸血症、酪氨酸血症、半乳糖血症(GALT)等;
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血液系統疾病:α/β 地中海貧血(HBA1/HBA2/HBB)、鐮狀細胞貧血、G6PD 缺乏症等;
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神經肌肉與發育疾病:脊髓性肌萎縮症 SMA(SMN1)、杜興氏/貝氏肌營養不良(DMD)、腓骨肌萎縮症(GJB1 等)、小頭畸形、Joubert 綜合症、腦白質營養不良(如 ALD)等;
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視聽覺疾病:先天性耳聾(GJB2/GJB3/SLC26A4 等 70+ 耳聾相關基因)、視網膜色素變性、Leber 先天性黑矇(RPE65 等)、Usher 綜合症;
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骨骼與結締組織病:成骨不全症(COL1A1/COL1A2)、軟骨發育不全(FGFR3)、Ehlers-Danlos 綜合症、短肋胸廓發育不良、多發性骨質硬化症等;
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皮膚與外胚層疾病:魚鱗病(TGM1/ABCA12 等)、白化病(TYR/OCA2)、大皰性表皮鬆解症(COL7A1/LAMB3 等);
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腎臟與多系統綜合徵:多囊腎/腎單位腎癆(NPHP 系列)、Alport 綜合症(COL4A3/A4/A5)、Bardet-Biedl 綜合症、腎上腺腦白質營養不良(ABCD1);
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免疫與血液凝固缺陷:嚴重聯合免疫缺陷(IL2RG/RAG1/RAG2)、Wiskott-Aldrich 綜合症、血友病 A/B(F8/F9)、范可尼貧血系列等;
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其他嚴重染色體/基因相關先天畸形:如 Noonan 譜系、Cornelia de Lange 相關基因、染色質修飾異常相關智力障礙等。